Estou razoavelmente seguro de que o automount não possui opções de pós-desmontagem. Mas eu encontrei algo na página man do sdparm (1.07):
-r, --readonly
override other logic to open DEVICE in read-only mode. This option may be useful if a command is being sent to an ATA disk via a SCSI command set. For example in Linux '-C stop' may require this option to stop an ATA disk being restarted immediately.
Eu não tenho um disco rígido USB no momento, so não posso testá-lo, mas isso parece combinar com o problema que você está tendo. Não sei como medir o tempo ocioso da unidade, no entanto.
Se o disco não ficar de fora desta opção, você pode ter encontrado este problema descrito no mesmo manual:
In the Linux 2.6 series, especially with ATA disks, using sdparm to stop (spin down) a disk may not be sufficient and other mechanisms will start the disk again some time later. The user might additionally mark the disk as "offline" with 'echo offline > /sys/block/sda/device/state' where sda is the block name of the disk. To restart the disk "offline" can be replaced with "running".
Você também pode combinar a montagem automática com a ejeção. Isso é usar o automount para montar e ejetar para desmontar. Parece funcionar muito bem, mas ejetar tem que ser executado com permissões de root.