Até onde eu sei, não há solução que funcione uniformemente para console e GUI, então você precisa mudar isso duas vezes. Use loadkeys para modificar o teclado do console e xmodmap para o teclado X11. Os detalhes, em particular para xmodmap , dependem muito das teclas que você deseja modificar - há diferenças entre as teclas regulares e as teclas modificadoras, como Ctrl ou Alt.