OP esclareceu em um comentário que a idéia é lançar o aplicativo em login , não em inicialização.
Procure por ~/.xinitrc
(este arquivo normalmente não existe, X inicia /etc/X11/xinitrc
como um fallback aqui no Fedora, ele pode fazer diferente em outras distribuições). Esse arquivo determina quais aplicativos iniciar por padrão. Dependendo do ambiente de área de trabalho configurado para a conta, outros arquivos de inicialização podem entrar em ação.
Cuidado, brincar com isso pode bloquear a conta para sempre.