Se você quiser que todos os arquivos em A existam em B, você pode simplesmente usar rsync com a opção --remove-source-files , para adicionar / atualizar os arquivos em B, com aqueles em A, e então apagar os arquivos originais de R. Ou com um pouco mais de hacking, executando rsync em --dry-run mode e canalizando a saída por grep , xargs e rm -f , apenas compare as duas estruturas de diretório e exclua os arquivos idênticos, consulte :
Linux / Unix rsync: Excluir arquivo de origem após a transferência
rsync --remove-source-files exclui arquivos fonte um por um ou depois que o rsync é concluído?