Posso pensar em dois possíveis problemas:
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Se você não tiver nenhum ícone em sua área de trabalho, poderá tê-los desativado acidentalmente (ou seja, fez com que eles não sejam exibidos). O Gnome pode fazer isso, que é o ambiente de desktop padrão que o CentOS vem com o I think
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Se houver outros ícones, provavelmente você está executando
ls
em um diretórioDesktop
que não é seu, mas de outro usuário (como sugere @Hanan N., pode ser raízes).cd
no diretórioDesktop
e observe a saída depwd
. Deve ser/home/<your_username>/Desktop
.