Por favor, defina "verificação de atualizações" ... você quer dizer que ele verifica se o repo. os metadados são válidos? Você pode alterar isso com a variável metadata_expire (veja man yum.conf), mas em geral eu não recomendaria correr contra dados antigos.
Se você quer dizer as verificações de obsoletos, você pode desativar isso ... mas, novamente, isso não é recomendado.