Ter crontab
preparado para criar ou remover um arquivo em /var/lock/
e fazer com que o programa teste a existência desse arquivo. Se o arquivo existir, recuse-se a executar.
Observe que isso não impedirá que um usuário determinado e inteligente simplesmente copie o programa e o altere para ignorar o teste, mas, novamente, o uso de cron
-scheduled chmod -x/+x
não impedirá os usuários inteligentes ...