Você pode ter removido acidentalmente a "bandeja do sistema" do painel superior. Outras aplicações ainda mostram seus ícones no topo?
Estou usando o Ubuntu 10.10. Recentemente estou encontrando este erro. Quando eu costumava fechar o cliente skype, ele costumava ir para a área de trabalho. (O painel acima, onde a hora e a data são geralmente exibidas.) Agora, quando estou fechando, estou fechado e não sei onde ele está localizado. Então, quando eu tento entrar novamente, diz que está em execução outra versão do Skype.
Qualquer ideia de como corrigir isso.