Você poderia usar sed com citações cuidadosas:
sed "s/^COMMENT AS \'\(.*\)\'$/COMMENT ''/"
Aqui, usei aspas duplas para cercar a declaração por causa das aspas simples internas.
Os back-ticks precisam ser escapados do shell.
Os parênteses são escapados para fazer sed capturá-los (para reinserção posterior com o token ).
Eu também ancorei o texto no início ( ^ ) e no final ( $ ) da linha.