Se você não se importa com os timestamps, pode usar o comando history -s para adicionar linhas ao bash history.
bash-4.2$ history -s foo
bash-4.2$ history -s this is a command
bash-4.2$ history 3
31 foo
32 this is a command
33 history 3
Você pode manipular seu arquivo de texto para gerar os comandos history -s e, em seguida, source it.