Então eu tentei várias coisas. Finalmente eu apenas abri a caixa e parecia que apenas um fã de três estava ficando louco assim. Então notei que a placa tinha sido instalada no segundo slot PCI. Eu mudei para o topo, e então todos os problemas desapareceram magicamente. Eu acho que isso é um problema com os drivers, ou como o X gerencia o cartão.