Você pode tentar isso:
Exec=bash -c "GDK_BACKEND=x11 /home/glodt/Software/eclipse-4.7/eclipse"
Terminal=true
você também pode tentar sh
Exec=sh -c "GDK_BACKEND=x11 /home/glodt/Software/eclipse-4.7/eclipse"
Terminal=true
Não tenho certeza se você precisa de Terminal=true