Não se esqueça de fazer referência à Documentação oficial do SO do Qubes para obter qualquer informação de que você precisa. Eles têm um guia útil localizado aqui sobre como criar uma VM modelo. O processo é muito direto, no entanto, refere-se ao Arch Linux, mas você pode substituir as alterações perto do final para o Ubuntu ou praticamente qualquer outro sistema operacional, em vez de Arch. Esse guia funciona para criar um modelo de VM com o "Qubes Way" e eu recomendo que você o leia e siga todas as etapas.
Se você é novato em sistemas operacionais Linux, sugiro que simplesmente execute o Ubuntu em seu computador ao invés de usar o Qubes OS, mas a documentação deve responder a maior parte de sua pergunta e as instruções de construção de modelos Archlinux são muito abrangentes e mostrará passo a passo o que você precisa fazer para ter um modelo de Ubuntu VM para sua instalação do Qubes. Melhor da sorte!