Como aumentar o limite de memória e o número de núcleos que o Rstudio usa em um cluster

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Eu lancei Rstudio usando FastX em Rivanna cluster ( CentOS Linux release 7.3.1611 (Core) ):

link

O principal objetivo para isso foi aumentar significativamente a velocidade de cálculos e o limite de memória, no entanto, quando eu iniciei os cálculos, eles são terrivelmente lentos, até mais lentos do que na minha máquina local. Além disso, o limite de memória também é muito baixo, então me deparei com um problema:

> sce <- newSCESet(countData=UMI_count)
Error in asMethod(object) : 
Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c

Parece que preciso especificar algumas configurações adicionais para aumentar o número de núcleos e memória que o Rstudio pode usar. Como eu pude fazer isso?

    
por Nikita Vlasenko 23.12.2017 / 23:25

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