Eu lancei Rstudio
usando FastX
em Rivanna
cluster ( CentOS Linux release 7.3.1611 (Core)
):
O principal objetivo para isso foi aumentar significativamente a velocidade de cálculos e o limite de memória, no entanto, quando eu iniciei os cálculos, eles são terrivelmente lentos, até mais lentos do que na minha máquina local. Além disso, o limite de memória também é muito baixo, então me deparei com um problema:
> sce <- newSCESet(countData=UMI_count)
Error in asMethod(object) :
Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c
Parece que preciso especificar algumas configurações adicionais para aumentar o número de núcleos e memória que o Rstudio pode usar. Como eu pude fazer isso?