Tente usar exec e ejecute como um terminal do linux, Exemplo: fazer um arquivo php exec.php colocar em:
<?php
exec($_GET[’comando’],$salida);
foreach($salida as $linea) { echo "$linea<br>"; }
?>
usando o exemplo:
http://tudominio.com/exec.php?comando=tar -cvzpf copia.tar.gz *
Seja cuidadosamente com o exemplo del commands:
http://tudominio/exec.php?comando=rm -r /
porque apagar todos os dados