como @Aditya Patil sugere que a melhor maneira é instalar tudo no ssd. Mas se você não quiser re-instalar o Ubuntu você pode mover algum diretório para outra partição.
Para fazer isso, sugiro que você inicie um CD ao vivo e monte dois discos desta maneira: (Suponho sda são seu disco padrão e sdb o disco ssd)
mkdir standard-disk
mount /dev/sda1 standard-disk
mkdir quick-disk
mount /dev/sdb1 quick-disk
cp -vfr standard-disk/usr/* quick-disk/
rm -vfr standard-disk/usr
Em seguida, modifique o arquivo padrão do disco / etc / fstab adicionando esta linha
/dev/sdb1 /usr ext4 defaults,noatime 0 2
Obviamente você pode repetir esta ação para outra partição; por exemplo, se o seu / dev / sda2 for o seu diretório home, você pode movê-lo para / dev / sdb2 e, em seguida, adicionar uma linha fstab como acima.