Você não pode - cron não é preciso o suficiente para isso.
Em vez disso, sugiro substituir f1 por um pipe nomeado, anexando um processo de leitor ao pipe nomeado. Esse processo seria lido exatamente por x segundos, copiando o que é lido em um arquivo com um nome de incremento sequencial previsível. Você pode então usar cron para colar periodicamente esses arquivos juntos em f2 , removendo aqueles que você já processou.