Então, não tenho certeza se devo postar isso aqui, mas:
Eu estou no Debian Jessie com o xfce4 como gerenciador de desktop e tenho layouts de teclado nos EUA e GR. Na janela de configurações 'layout do teclado', seleciono Alt + Shift como teclas de atalho, mas percebo que, na reinicialização, a configuração não é mantida. Eu não salvei a sessão para que não seja problema certo?
Atualmente, tenho uma solução alternativa: execute isso como um script setxkbmap -option grp:alt_shift_toggle us,il na inicialização.
Minha pergunta é por que as teclas não permanecem como teclas de atalho na inicialização?