No final, nosso administrador do servidor instalou os seguintes pacotes que resultaram em uma instalação bem-sucedida do PANDAseq:
libtool-ltdl-2.2.6-15.5.el6.x86_64
libtool-2.2.6-15.5.el6.x86_64
libtool-ltdl-devel-2.2.6-15.5.el6.x86_64
A PANDA está feliz agora:)