Encontrou o problema: há uma configuração em xfwm4-settings
chamada 'Novo foco de janela'
queeutinhadesmarcado,porqueeuodeioseosaplicativosiniciadosemumterminaltiramofocodajaneladoterminal.Noentanto,assimqueessaopçãoforselecionadanovamente,o"próximo editor" do Eclipse e as "janelas de troca rápida" funcionarão novamente.
Existe uma certa lógica, exceto que eu teria pensado que o "novo foco da janela" não se aplica aos diálogos no aplicativo, como o do "próximo editor".