Você não tem problemas com sua configuração de terminal ou terminal. Tente isto:
ls --color
Funciona, não funciona?
Provavelmente, você substituiu seu .bashrc. Você pode encontrar o .bashrc original, que por exemplo define o alias ls='ls --color=auto'
e também os prompts de cor em /etc/skel/
.
Copie um novo .bashrc
com:
mv ~/.bashrc ~/.bashrc.old
cp /etc/skel/.bashrc ~/.bashrc