deve ser fácil o suficiente para verificar o que está acontecendo usando o xinput.
obtenha o ID do dispositivo:
mouseId=$(xinput -list | grep -i Point | grep "PS/2" | cut -d "=" -f 2 | cut -b 1-2)
verifique os adereços com:
xinput --list-props $mouseId
será interessante ver qual o valor de "Device Enabled" em vários momentos (antes de clicar, depois de mover o mouse ...).
EDITAR:
Exemplo de xinput -list:
mike@mike-laptop4:~$ xinput -list
⎡ Virtual core pointer id=2 [master pointer (3)]
⎜ ↳ Virtual core XTEST pointer id=4 [slave pointer (2)]
⎜ ↳ SynPS/2 Synaptics TouchPad id=9 [slave pointer (2)]
⎣ Virtual core keyboard id=3 [master keyboard (2)]
↳ Virtual core XTEST keyboard id=5 [slave keyboard (3)]
↳ Power Button id=6 [slave keyboard (3)]
↳ Power Button id=7 [slave keyboard (3)]
↳ AT Translated Set 2 keyboard id=8 [slave keyboard (3)]
↳ HP Wireless hotkeys id=10 [slave keyboard (3)]