Eu apostaria em um erro transitório, no entanto, se as ferramentas de comando funcionarem, e você tiver esse erro, algo está errado. Talvez um bug do BIND, talvez alguma configuração de firewall (inspetores)
Seu sistema operacional e o BIND são bem antigos e EOL (2013, já que é o ramo de testes).
Eu atualizaria os dois com urgência; se você não tiver kernels e BIND compilados à mão, eles já têm alguns bugs desagradáveis que podem ser explorados remotamente.
Se o problema continuar presente, eu depurarei mais sobre o problema.