Graças à dica de Braiam, percebi isso. Na caixa de diálogo Preferências, verifique se "Acesso remoto" está ativado e verifique a porta (suponho que seja o padrão 9091). Para ativar o modo de tartaruga:
hdr='curl http://localhost:9091/transmission/rpc -sD- |grep -o '^X-Transmission-Session-Id: [A-Za-z0-9]*''
curl http://localhost:9091/transmission/rpc -d '{"method":"session-set","arguments":{"alt-speed-enabled":true}}' -H "$hdr"
E para desativar a tartaruga depois:
curl http://localhost:9091/transmission/rpc -d '{"method":"session-set","arguments":{"alt-speed-enabled":false}}' -H "$hdr"
Deixando isso para a próxima pessoa!