A EPEL tem uma versão mais recente em "atualizações de testes" . Você pode tentar usando
yum --enablerepo=epel-testing update gnucash gnucash-docs
Isso pode resolver os problemas. A versão antiga provavelmente é construída contra algumas bibliotecas antigas.
Se funcionou para você, sinta-se à vontade para relatar (dar karma) à atualização para que ela se torne estável. Ele fede lá por um longo tempo.