Um tempo atrás eu quase instalei uma atualização do GRUB
(gerenciador de inicialização Linux) no topo do meu gerenciador de inicialização do Windows. Isso tornaria o Windows não inicializável. Se esse for o seu caso, os dados da partição do Windows poderão ser recuperados copiando os dados de dentro do Kali ou usando o disco de instalação do Windows para reparar a instalação (você já tentou isso?).
Se você tiver realmente formatado a partição do Windows, poderá tentar recuperar os dados usando o software mencionado ou entregando o disco rígido a uma empresa de recuperação de dados. O problema é que quanto mais você escreve sobre a antiga partição do Windows, menos dados será possível recuperar.