Você poderia passar os arquivos concatenados para awk duas vezes, pela primeira vez ( NR==FNR ) para calcular a sum da terceira coluna ( $3 ) em todos os arquivos e pela segunda vez para substituir os valores existentes pela total:
awk 'NR==FNR{sum+=$3;next}; {$3=sum; print}' <(cat file1 file2...fileN) \
<(cat file1 file2...fileN) > result.txt