Eu estou no Elementary 0.3 Freya. Qual versão do Eclipse você está tentando executar? Se você não se importa com o Eclipse 3.8, você pode obtê-lo do apt-get com o eclipse sudo apt-get install e ele é bastante estável e rápido.
Se você quiser o Eclipse 4.0 ou superior, você precisará baixar o tar.gz do eclipse.org.
Por alguma razão, quando eu tento executar o eclipse dentro de um diretório inicial (como / home / user / Downloads / eclipse / eclipse) eu recebo o mesmo problema que você está descrevendo - minha máquina começa a paginar como um louco e congela (e eu tenho uma CPU Broadwell i5 ... 4g ram). Eu aumentei a memória Java VM e os tamanhos de paginação, como algumas páginas sugeriram, mas ela ainda congela.
Mas funcionou para mim (não mais atraso) quando segui exatamente esses passos
Qual é:
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sudo apt-get instala o openjdk-7-jdk
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baixe o eclipse do link (eu baixei o Juno 4.2)
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tar zxvf eclipse-SDK-4.2-linux-gtk-x86_64.tar.gz ou qualquer que seja o arquivo que você baixou
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sudo eclipse mv / opt /
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vi ~ / .local / share / applications / eclipse.desktop ou com seu editor favorito para ter o seguinte:
[Desktop Entry] Version=4.4.0 Name=Eclipse Comment=Eclipse IDE Exec=/opt/eclipse/eclipse Icon=/opt/eclipse/icon.xpm Terminal=false Type=Application Categories=Development;Application
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Em seguida, você pode encontrar sua entrada na área de trabalho do Eclipse no Slingshot e iniciá-la.
Boa sorte