Você precisará chroot (mudar a raiz) para o sistema instalado, uma vez que você tenha iniciado a partir do live cd / usb.
Excelentes instruções sobre como criar o ambiente chroot estão aqui:
Eu usei essas instruções várias vezes - leia e entenda cada etapa antes de começar - preste atenção especial à seção referente a uma partição de inicialização separada.
Uma vez que você está chrooted, não há necessidade de fazer a purga completa e reinstalação do grub nas instruções, a menos que você queira por completo, mas emita o seguinte:
apt-get install --reinstall linux-image-generic linux-image
update-initramfs -u -k 3.13.0-55-generic #this is the version mine is using, yours might differ - you can check by using "uname -r" in terminal
update-grub
shutdown -r 0
Isso deve reinstalar o kernel mais recente. Uma vez que você é inicializado de volta ao seu sistema instalado ao invés do live cd / usb, você pode:
sudo apt-get autoremove
para se livrar dos kernels adicionais e desnecessários.
Espero que ajude.