Não há configuração de tema de ícones global, portanto, isso não pode ser feito em princípio. Se você alterar o seu tema de ícones do KDE, ele não mudará seus ícones em seus aplicativos GNOME.
Os aplicativos do KDE, quando executados em um ambiente GNOME, usarão as configurações do tema GNOME, mas isso não é devido a configurações globais, mas sim porque o kit de ferramentas do Qt adicionou um mecanismo para detectar o tema GNOME e usá-lo. Ainda é uma configuração específica do GNOME, e não será transferida se você mudar para outro ambiente de área de trabalho.