Se for uma instalação multi-site, o Drush precisa saber para qual "site" (um dos multi-sites suportados pela instância do Drupal) o comando Drush deve ser aplicado.
Certifique-se de primeiro navegar para a subpasta "sites". Tente executar o mesmo comando Drush. Eu acredito que então você vai querer que os sites / todas as subpastas sejam atualizados. Se você ainda tiver o mesmo problema, tente navegar até a subpasta de sites "padrão" (ou qualquer outra subpasta correspondente a qualquer um dos outros sites relacionados a essa configuração de vários sites e tente novamente.