Eu tive o mesmo problema e a solução foi editar o arquivo /etc/rc.local
. Agora esse arquivo se parece com:
#My laptop have three USB ports
echo USB0 | sudo tee /proc/acpi/wakeup
echo USB1 | sudo tee /proc/acpi/wakeup
echo USB2 | sudo tee /proc/acpi/wakeup
exit 0
...it disables only the monitorization of those ports during suspension/hibernation.[1]