Instale-o com o comando: sudo apt-get install pepflashplugin-installer
Então você deve dizer cromo para usar o plugin do pepperflash. Se você tiver instalado corretamente, siga as próximas etapas para ativá-lo:
1) Abra a configuração sudo gedit /etc/chromium-browser/default
2) Anexe esta linha ao final: . /usr/lib/pepflashplugin-installer/pepflashplayer.sh
3) Reinicie o navegador Chromium, acesse chrome://plugins
e verifique a versão do Adobe Flash Player (é possível que você tenha dois, não é necessário desativá-lo porque o Pepper Flash será usado por padrão, já que é mais recente)