Você não disse qual distro de Linux você instalou, mas vou fazer uma suposição errada aqui, já que você tem um pendrive com o Ubuntu, você está rodando o Ubuntu.
Além disso, verifique se você tem um backup. Você ainda pode acessar seus arquivos montando a unidade. Eu explico como montar abaixo, ou você pode olhar para páginas de manual.
Existe um programa chamado reparo de inicialização . Abra seu ubuntu rodando em seu pen drive e instale-o com:
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo sed 's/trusty/saucy/g' -i /etc/apt/sources.list.d/yannubuntu-boot-repair-trusty.list
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && (boot-repair &)
Depois, defina suas configurações e aponte para a sua unidade. Provavelmente será sda
, mas você pode procurar com lsblk
. Então, qualquer tabela de partição parece com o que você lembra é provavelmente a unidade.
Se houver alguma dúvida sobre o que está lá, use (como exemplo) sudo mount /dev/sdX1 /mnt
para montá-lo para que você possa dar uma olhada. Em seguida, apenas cd /mnt
para alterar os diretórios para o seu ponto de montagem.