Eu entrei em contato com a Supermicro sobre o problema e eles me deram um BIOS beta para a placa-mãe tentar. Surpreendentemente, isso resolveu o problema. Como o BIOS não está publicado em seu site, vou deixar um link aqui para o caso de alguém estar com esse problema. Use o BIOS por sua conta e risco, pois é um BIOS beta.