Bem, tenho vergonha de dizer que havia outras pastas .htaccess
in wp-content
e wp-include
com a seguinte regra:
<FilesMatch "\.(?i:php)$">
<IfModule !mod_authz_core.c>
Order allow,deny
Deny from all
</IfModule>
<IfModule mod_authz_core.c>
Require all denied
</IfModule>
</FilesMatch>
Muitas horas quebrando minha cabeça com o teclado por causa disso.