Parece que você excluiu acidentalmente o diretório /etc/skel . Verifique digitando o seguinte comando em um terminal:
ls -ld /etc/skel
Se o diretório existir, poste a saída deste comando para diagnóstico adicional.
Se o diretório não existir, crie-o:
sudo mkdir /etc/skel
Você também deve reinstalar os pacotes que possuem arquivos em /etc/skel . Você vai atualizar bash de qualquer maneira. Verifique se há outros executando o comando dpkg -S /etc/skel . Se isso listar pacotes diferentes de base-files e bash , execute apt-get --reinstall install on them, e.g. apt-get --reinstall install mksh syslogout '.