Em sistemas GNU:
d1=2017-04-25T07:19:53.946109551Z
d2=2017-04-25T07:19:53.946155414Z
printf '%s - %s\n' "$(date -d "$d2" +%s.%N)" "$(date -d "$d1" +%s.%N)" | bc
Daria a você a diferença de tempo como um número de segundos em ponto flutuante.
Ressalva: o número será dado usando o período ( . ) como o separador decimal, mesmo em locais onde a vírgula ( , ) é usada.
Você pode canalizar essa saída para tr . "$(locale decimal_point)" para corrigi-lo.
Ou, com zsh , você poderia fazer:
printf '%.9f\n' $(($(date -d "$d2" +%s.%N) - $(date -d "$d1" +%s.%N)))
em vez disso, o que lhe dará um número com o separador decimal correto em sua localidade.
No entanto, desde então, zsh usa o formato de número double do seu processador, você pode descobrir que ele fornece um número diferente, pois números como 1493104793.946109551 atingem o limite de precisão desses números. bc não tem o problema, pois usa precisão arbitrária.
zsh tem recursos de análise de tempo embutidos, então também é possível escrever uma solução que funcione em sistemas não-GNU como:
parse_iso8601_full() {
local t
typeset -Fg REPLY
zmodload zsh/datetime
TZ=UTC0 strftime -r -s t %Y-%m-%dT%H:%M:%S ${1%.*} &&
REPLY=$t.${${1%Z}##*.}
}
parse_iso8601_full $d1; t1=$REPLY
parse_iso8601_full $d2; t2=$REPLY
printf '%.9f\n' $((t2 - t1))