A GNU GPL cobre apenas distribuição ; você nem precisa obedecer aos seus termos, desde que não compartilhe sua distribuição Linux com ninguém. Se você compartilhá-lo, qualquer pessoa que receber uma cópia tem o direito de exigir que você forneça o código-fonte. Alternativamente, você poderia adotar uma abordagem semelhante à da Red Hat, que é publicar apenas o código-fonte, mas fornecer binários compilados apenas para clientes pagantes.
Se você quer construir um produto de código fechado, o GNU / Linux é uma base ruim para começar. Você poderia considerar personalizar um sistema baseado no BSD.