Ugh, acontece que um arquivo diferente foi gerado depois que eu deletei o inicial e eu acabei de errar. Excluiu aquele e as coisas parecem estar de volta correndo. Grandes sugestões nos comentários acima, embora!
@ A sugestão do gullum de sudo ls -l /proc/*/fd | less
fez essencialmente o que eu estava procurando fazer com lsof
.