Isso não é específico do Linux. Um determinado disco com um rótulo de disco do DOS só pode ter quatro (4) partições primárias. Para obter mais de quatro partições, o quinto e além são partições lógicas, que estão totalmente contidas na quarta e última partição primária. Efetivamente, é um artefato do rótulo de disco do DOS, e não há outra diferença real no nível que você está perguntando.