Você só precisa definir a variável R ecord S eparator, seja no início da seção BEGIN ou com a opção -v :
$ awk -vRS='@#' 1 file
CCJSH PREMIUM
I5001
7
5976
7
0.2
5195
5231
0.2
39
5197
39
Da mesma maneira, você pode definir O utput R ecord S eparator.