bem, o Ubuntu usa sistemas de arquivos diferentes do Windows.
seu disco rígido externo provavelmente está no formato de sistema de arquivos ext4 agora, em vez de NTFS ou gordura que o Windows gosta de ler. então sua resposta curta seria não, não vai funcionar assim ...
Mas, você pode usar isso: link
ele permitirá que você leia o disco rígido externo e extraia arquivos dele, mas não me lembro se ele permitirá que você grave nele ... por que não experimentar o programa e brincar com ele um pouco? :)