O FFmpeg é composto de várias bibliotecas, cada uma dedicada a certas partes do pipeline de processamento de mídia e ferramentas, como o binário ffmpeg, que configura o pipeline e gerencia sua execução. A página de doc que você vinculou está relacionada ao binário ffmpeg. No entanto, a taxa de bits é uma opção relacionada à codificação e está documentada na página libavcodec em link
No token -b:a
, a parte antes dos dois-pontos identifica a opção, nesse caso, bitrate. A string após o (primeiro) cólon é o especificador de fluxo e é usada para identificar o destino da opção . Então, -b:a:2
define a taxa de bits para o terceiro fluxo de áudio na saída.