Usando sed
:
$ sed '2,$s/,/.1,/2' file
ip,time,name
1.1.1.1,2018-08-31 10:01:03.1,postgres
2.1.1.1,2018-08-31 12:51:13.1,oracle
3.1.1.1,2018-08-31 14:32:53.1,sql
Isso aplica uma substituição à linha 2 e adiante ( 2,$
). A substituição s/,/.1,/2
substitui a segunda vírgula por .1,
. É o /2
no final do comando de substituição que faz com que ele passe para o segundo jogo.