Você sempre pode executar suas atualizações e selecionar o que instalar ou não. Então, quando você vir uma atualização para o Clementine, simplesmente desmarque a atualização no gerenciador de atualização e você sairá bem.
A desvantagem é que você terá que desmarcá-lo toda vez que executar suas atualizações.
Esta é a maneira mais fácil.