Eu mesmo tive problemas com ventiladores na CPU Lenovo Y580 Intel® Core ™ i7-3630QM com placa gráfica interna hd 4000 e placa gráfica nvidia gtx660.
Eu simplesmente mudei o GPU nas configurações do servidor Nvidia X (driver proprietário) para Intel.
Você pode usar o instalador gráfico da Intel, ele funciona bem no Ubuntu 14.04.