Em uma determinada versão do Ubuntu, o software normalmente não é atualizado para versões mais recentes do upstream, ele só recebe correções de segurança e correções para bugs sérios. No caso do Tomcat, o Ubuntu 16.04 possui 8.0.32 e várias correções de segurança (veja a página do pacote para detalhes). Portanto, executar 8.0.32 ainda é seguro.
Se você realmente precisar atualizar para o 8.0.46 (e eu não acho que há muita razão para você, dado o acima), você precisará construir você mesmo.