Eu acredito que você precisa
install -t "$(DESTDIR)/usr/lib/myApp/scripts/network" -D src/scripts/*
Isto irá criar $(DESTDIR)/usr/lib/myApp/scripts/network
(incluindo diretórios intermediários) e copiar os arquivos src/scripts/*
lá.
Teste (com verbosidade extra ativada):
$ touch file-{1,2,3,4}
$ install -v -t test/dir -D file-[1-4]
install: creating directory 'test'
install: creating directory 'test/dir'
'file-1' -> 'test/dir/file-1'
'file-2' -> 'test/dir/file-2'
'file-3' -> 'test/dir/file-3'
'file-4' -> 'test/dir/file-4'
Isso funciona com o GNU install
do coreutils 8.25, mas falha com o coreutils 8.4. Para implementações mais antigas do coreutils, faça isso em duas etapas:
install -d "$(DESTDIR)/usr/lib/myApp/scripts/network"
install -t "$(DESTDIR)/usr/lib/myApp/scripts/network" src/scripts/*
... ou algo semelhante.