Este é um problema muito comum com o zip do linux ... se você fizer
unzip *.zip
e você diz três arquivos:
a.zip
b.zip
c.zip
expande-se para significar
unzip a.zip b.zip c.zip
que parece bom, mas diz descompactar para descompactar b e c de dentro de um, o que é incorreto. Isso não funcionará. (verifique no seu sistema local).
A solução é
unzip '*.zip'.
Você precisará escapar do 'em seu ssh (por exemplo, barra invertida ou usar duplas).